Lara Schaffner werd in Schaffhausen/CH geboren. Van 2001 tot 2008 studeerde zij an de Musikhochschule te Luzern in de pianoklas van Yvonne Lang (Docerend Musicus 2005) en daarna in de orgelklas van Monika Henking (Docerend Musicus en Uitvoerend Musicus cum laude 2008).
Vervolgens zette zij haar studie voort aan het Rotterdams Conservatorium bij Ben van Oosten (Masteropleiding) met als zwartepunt Franse symfonische orgelmuziek. Bij Aart Bergwerff volgde zij improvisatielessen. In het kader van deze masteropleiding heeft zij artistiek onderzoek gedaan naar Marcel Dupré’s Le Chemin de la Croix. In 2010 is zij met haar examenconcert in de Kathedrale Basiliek Sint Bavo te Haarlem „cum laude“ afgestudeerd.
Lara Schaffner was in 2006 und 2007 prijswinnaar van de nationale studieprijs van het „Migros-Kulturprozent“ en ontving in 2008 de Edwin-Fischer-Gedenkpreis voor haar eindexamen orgel. Verschillende masterclasses met o.a. Olivier Latry, Louis Robilliard en Gillian Weir gaven haar belangrijke impulsen.
Sinds september 2013 is zij benoemd tot hoofdorganiste van de Stadtkirche te Glarus/CH. Zij treedt als organiste solistisch en kamermuzikaal in Zwitserland en daarbuiten op. Van 2015 tot 2022 was zij artistiek leider van de Adventskonzerte in St. Luzi te Chur.